生物多样性和生态工程教育部重点实验室（Ministry of Education Key Laboratory for Biodiversity Science and Ecological Engineering）成立于2000年，挂靠在复旦大学和北京师范大学，是我国第一个以生物多样性为研究主题的教育部重点实验室。主要研究方向包括：生物多样性与环境变化、生物入侵及其后果、生态工程原理及其应用。

目前有公共实验室共计：9间，具体如下：

上述公共实验室对生物多样性与生态工程教育部重点实验室全体教师和研究生开放。为了公共实验室的规范管理，公共实验室全部安装门禁系统，研究生可以按需向上述公共实验室的管理员申请开通门禁。在管理员不在时，研究生可以凭填写好的《生物多样性与生态工程教育部重点实验室公共实验室门禁开通申请单》（在G513领取），向G513房间提供公共服务的老师申请开通门禁，并在《学生开通门禁登记表》上进行登记。